只有科学施肥，才能提高化肥增产效益，降低农业成本；只有科学施肥，才能解决土地环境资源的再有效持续利用。
酵素菌肥料是采用酵素菌发酵天然有机物料精制而成的有机肥料，添加特功能菌后可制备成生物有机肥。酵素菌肥含有丰富的有机质和大量有益微生物和氮、磷、钾等大中微量元素养分。酵素菌肥在腐殖化过程中形成中性腐植酸（腐殖质），具有显著改善土壤的理化状况， 增强土壤的保水保肥能力，提高地温3至5℃。与此同时，肥料中大量活性有益微生物在土壤中繁衍，将土壤中难于分解和未被分解的动、植物残体进行分解，对残留在土壤中的植物残体进行腐解，形成土壤有益微生物群，具有解钾、释磷和固氮功效，溶解土壤中被固定的营养成分，转化成可被植物吸收的养分；同时还能促进。所以施用酵素菌肥料，不仅能给植物提供生长所必需的养分、提高化学肥料的利用率，而且还能有效防止土壤的板结。
酵素菌是发酵型微生物群，尽管也有功能菌的效应，但仍不能保证其发酵有机肥中功能菌的数量，因此要制备生物有机肥，仍需要根据肥料登记证中所示微生物种类进行相应比例的添加。实践表明，利用酵素菌发酵的有机肥料所含的有益微生物与绝大多数功能菌是相容的，甚至是增效的。
对于以矿源腐植酸为材料，潍坊加潍生物科技有限公司研制的“菌菌有为”酵素菌种是专门优选能够降解褐煤、风化煤的微生物而成的特定发酵微生物群，也是目前公认的高效腐植酸有机肥发酵菌种。
