腐植酸文献

DNA不同提取方法对养殖池塘底泥细菌多样性PCR-DGGE检测的影响

作者:王宇;林文辉;王亚军;毕晔;石存斌;吴淑勤
单位:中国水产科学院珠江水产研究所;大连水产学院生命科学与技术学院
文献来源:吉林农业大学学报;   时间:1970-01-01

摘要: 应用PCR-DGGE技术研究了养殖池塘底泥中细菌DNA 5种提取方法对细菌多样性检测的影响。结果显示:(1)DNA粗提液中腐殖酸与蛋白的纯度无正相关;(2)5种方法提取的DNA粗提液经过纯化后进行PCR均取得良好结果;(3)采用复合破壁方法提取养殖池塘底泥细菌DNA有利于显示细菌多样性;(4)DNA提取方法是影响池塘底泥细菌多样性PCR-DGGE结果的关键因素,与DNA的产量、纯度关系甚微;(5)5种方法相似性高达0.79,在对养殖池塘底泥细菌多样性进行粗略分析时均可使用;(6)本试验中,基于改进的Martin-Laurent法是用于养殖池塘底泥细菌多样性PCR-DGGE研究的较好的总DNA提取方法。

关键词: 养殖池塘底泥;细菌多样性;DNA提取;PCR-DGGE;优势种群